Fruit Ninja to gra, w której wcielamy się w tytułową postać ninja i… trafiamy do kuchni gdzie tniemy owoce. Te są wyrzucane z dołu ekranu, razem z bombami, których uderzenie kończy zabawę. Całość została wykonana w humorystyczny sposób i okraszona dodatkami, przez co Fruit Ninja potrafi zająć dłuższe chwile.
Gra posiada trzy różne tryby: klasyczny, nieograniczony czasowo, w którym musimy przecinać wszystkie owoce, w przeciwnym wypadku tracimy ograniczone liczbowo szanse. W trybie tym uderzenie w bombę kończy grę. Drugim trybem jest Arcade, ograniczony do 60 sekund tryb, w którym nie musimy pilnować każdego owocu, a uderzenie w bombę jedynie na chwilę przerywa rozgrywkę. Występują w nim banany-bonusy powodujące np. zalew owoców. Ostatni z trybów, Zen, to jak nazwa wskazuje, tryb spokoju. Jest on ograniczony czasowo do 90 sekund, nie występują w nim żadne bomby, podobnie jak w arcade można natrafić na owoce specjalne.
W trakcie gry zbieramy punkty, za które można wykupić ulepszenia np. odbijanie bomb przez odpowiedni ruch, lub częstsze występowanie specjalnych owoców. Kolejnym dodatkiem są osiągnięcia np. przecięcie 50 sztuk odpowiedniego owocu odblokowuje nowe tła i wygląd śladu po mieczu. Gra jest dostępna za darmo. Jej autorzy dbają o częste aktualizacje, związane z różnymi wydarzeniami.