Jmol to szybki i lekki program do oglądania modeli molekuł i struktur krystalicznych w trzech wymiarach, który do renderowania nie wymaga specjalnego sprzętu ani mocnego komputera. Program wykorzystuje autorski silnik, który pozwala nawet na słabszych komputerach komfortowo animować, obracać i oglądać modele z różnych stron.
Jmol został wyposażony w wyszukiwarkę online molekuł, może też otwierać pliki w kilkudziesięciu formatach: MOL, XYZ, CSF, CIF, CML, PDB, PQR i wielu innych, także pochodzących ze specjalistycznych programów. Widok molekuły można wyeksportować w różnych formatach graficznych, renderować z użyciem POV-Raya lub zapisać jako model w formatach Maya, VRML, X3D oraz jako strona internetowa.
Poza możliwością przyjrzenia się modelom z różnych stron program pozwala mierzyć kąty i odległości, symulować wibracje i animować molekuły. Można także przygotować dla niego skrypty w języku RasMol/Chime.
